Cercetătorii de la Stanford Medicine și de la Sistemul de Sănătate VA Palo Alto au dezvoltat testul, numit uRARE-seq (secvențiere aleatorie a ARN-ului și captura de afinitate a fragmentelor de ARN liber celular pentru analiză prin secvențiere). Într-un studiu cu 683 de probe de urină raportat în revista Nature Medicine, abordarea a detectat 95% din cancerele de vezică localizate la o specificitate de 90%.
Spre deosebire de multe biopsii lichide care caută mutații ale ADN-ului asociate cu tumora, uRARE-seq analizează fragmente de ARN liber celular (cfARN) eliberate în urină. Deoarece ARN-ul reflectă genele pe care celulele le exprimă activ, poate oferi informații despre biologia tumorii, precum și dovezi că cancerul este prezent.
Testele pentru cancerul de vezică bazate pe urină există deja. Testele aprobate de FDA includ NMP22, care detectează o proteină asociată cu cancerul, și UroVysion, care identifică anomalii cromozomiale. Testarea urinei bazată pe ARN nu este nici ea complet nouă. Xpert Bladder Cancer Monitor, de exemplu, măsoară cinci markeri de ARN mesager pentru a monitoriza cancerul de vezică diagnosticat anterior și este disponibil pe unele piețe din afara Statelor Unite.
uRARE-seq merge mult mai departe. „O caracteristică distinctivă cheie a cfARN față de abordările cu utDNA este capacitatea de a profiliza expresia a mii de gene”, au scris autorii. Modelul lor de detectare a cancerului de vezică a inclus 381 de gene.
Această abordare ar putea evita, de asemenea, o problemă cu testarea ADN-ului din urină. Celulele normale din mucoasa vezicală pot acumula mutații care se suprapun cu cele găsite în tumori, un fenomen cunoscut sub numele de efect de câmp. Cercetătorii au constatat că detectarea bazată pe cfARN nu pare să fie afectată de aceste mutații.
uRARE-seq a arătat o sensibilitate pretratament mai mare decât citologia urinară și un test de ADN tumoral de urină naive la tumori, în timp ce a avut performanțe similare cu o abordare de secvențiere a ADN-ului țintit informată de tumori. Cu toate acestea, spre deosebire de un test informat de tumori, uRARE-seq nu necesită secvențierea tumorii unui pacient în prealabil.
Cea mai puternică aplicație a medicinei personalizate ar putea fi selecția tratamentului. Mulți pacienți cu cancer de vezică non-musculară invazivă primesc Bacil Calmette-Guérin (BCG) intravezical după intervenția chirurgicală, dar nu toți răspund.
Urina pretratament a pacienților care ulterior au avut un răspuns molecular complet la BCG a arătat semnături mai puternice ale expresiei celulelor T și ale altor semnături legate de imunitate. Pacienții care au prezentat boală moleculară reziduală după BCG au arătat, în schimb, o expresie mai mare a genelor asociate cu proliferarea.
Folosind aceste diferențe, cercetătorii au dezvoltat un model care prezice probabilitatea de răspuns la BCG versus chimioterapia intravezicală. În probele de urină pretratament de la 114 pacienți, modelul a arătat o precizie predictivă ridicată, obținând un scor de 0,93 pe o scară în care 1.0 reprezintă o discriminare perfectă între răspunsurile la tratament. Testul a detectat de asemenea mol
Sursa articol https://insideprecisionmedicine.com
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
