Descoperirile, publicate în revista Science Translational Medicine, oferă posibilități până acum nerecunoscute pentru fragmentarea ADN-ului la nivel genomic, liber în celule (cfDNA), în biopsiile lichide.
Acest „fragmentom” de informații genetice, găsit în circulație după ce a fost eliberat din celulele care mor, a arătat deja promisiuni în detectarea cancerului.
Acum, cercetătorii au descoperit că poate detecta non-invaziv bolile de ficat, și sugerează că ar putea ajuta la necesitatea clinică nesatisfăcută pentru biomarkeri accesibili pentru a îmbunătăți detectarea precoce într-un spectru larg de boli.
„Specificitatea bolii abordării și capacitatea de a extrage informații fragmentome la nivel genomic legate de mai multe boli dintr-o singură probă de sânge ar putea, într-o zi, permite un test facil și accesibil de biopsie lichidă pentru screening non-invaziv, multi-bolilor,” conform cercetătorului Victor Velculescu, PhD, de la Școala de Medicină a Universității Johns Hopkins, și colegii săi.
Biomarkerii plasmatici bazati pe cfDNA au arătat promisiuni pentru detectarea cancerului, identificarea răspunsului la terapie și recurența tumorii, teste prenatale și monitorizarea transplantului de organe.
Dimensiunea genomică la nivel mondial, distribuția acoperirii și conținutul genomic al fragmentelor cfDNA reflectă stările genomice, cromatine, transcriptomice și epigenomice subiacente ale celulelor din care provin.
Prin urmare, cercetătorii au considerat că fragmentomele cfDNA ar putea servi drept biomarkeri non-invazivi sau minim invazivi pentru boli complexe care lipsesc de screening eficient, inclusiv boli comune de origine inflamatorie sau fibrotică care devin mai frecvente odată cu vârsta.
Pentru a investiga mai departe, Velculescu și echipa sa au aplicat secvențierea întregului genom fragmentomelor cfDNA la 1576 de persoane, inclusiv cele cu boli hepatice, tulburari autoimune sau condiții neurodegenerative.
Un algoritm de învățare automată a putut identifica markeri în fragmentom care au distins boala de ficat incipientă, fibroza avansată și ciroza, au raportat aceștia.
Markerii au arătat o sensibilitate mare când au fost aplicați într-un grup de descoperire separat de 423 de indivizi și o cohortă de validare de 221 de persoane.
Autorii notează că aceste schimbări reflectau atât contribuțiile organelor țintă la cfDNA, cât și schimbările mediate imunologic în conținutul de celule albe din sânge în cfDNA.
Schimbările în fragmentom au fost, de asemenea, legate de bolile de inimă, diabet și alte tulburări cronice, iar modelul de învățare automată a putut prezice supraviețuirea globală într-un grup de descoperire de 571 de persoane, precum și o cohortă de validare de 231 de indivizi.
Cercetătorii au sugerat, așadar, că schimbările în fragmentomul cfDNA par să fie prezente în condiții suplimentare dincolo de boala de ficat și pot servi ca o măsură a morbidității clinice.
Ei au adăugat: „Locația genomică, extinderea și tipul acestor modificări variază în funcție de starea de boală și pot fi”.
Sursa: [Science Translational Medicine](link)
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.