Autorul principal Hariharan Easwaran, PhD, profesor asociat de oncologie la Școala de Medicină de la Universitatea Johns Hopkins, a remarcat că abordarea lor de a folosi semnalele de metilare pentru detectarea cancerului este diferită de metodele actuale. Acesta a menționat că, în timpul carcinogenezei, metilarea ADN-ului este adesea pierdută pe regiuni extinse ale genomului, în timp ce regiunile înguste bogate în dinucleotide de citozină-guanină (insulele CpG) tind să capete metilare de ADN. Aceste modificări de metilare asociate cu cancerul apar adesea într-un mod mozaic, heterogen, la nivel celular și al alelelor, în conformitate cu achiziția parțial stochastică în loc de un comutator on/off complet determinist la fiecare loc, reflectând instabilitatea epigenetică subiacentă în menținerea informației epigenetice, care este deosebit de pronunțată în cazul cancerelor.
Datorită acestui fapt, modificările de metilare în insulele CpG sunt considerate biomarkeri buni. Aceste schimbări epigenetice evoluează într-un mod foarte stochastic, cu heterogenitate interindividuală și intra-tumorală, indicând potențial instabilitatea subiacentă în menținerea metilării ADN-ului la aceste regiuni.
„De obicei, majoritatea studiilor selectează regiuni care prezintă cele mai mari diferențe specifice cancerului în media metilării ADN-ului (regiuni diferențial metilate) în comparație cu controalele normale”, a spus el. „Am formulat ipoteza că, deoarece metilarea la acești loci este heterogenă și dependentă de cohortă, atât amplitudinea schimbării, cât și regiunile specifice identificate pot varia, limitând robustețea unor astfel de markeri între cohorturi. Dacă metilarea la acești loci apare într-un mod parțial stochastic, atunci identificarea regiunilor pe baza gradului de instabilitate epigenetică și dezvoltarea de metrici bazate pe cfDNA pentru a cuantifica această instabilitate ar putea oferi abordări mai fiabile pentru detectarea cancerului.”
În timp ce unele metode de biopsie lichidă existente pot detecta cancerul prin identificarea diferențelor absolute în metilare la site-uri individuale de CpG, abordările acestea pot funcționa bine în populații definită îngust, dar s-ar putea să nu se generalizeze în grupuri diverse de pacienți. Cercetările anterioare au arătat că evoluția cancerului se caracterizează prin o extensivă heterogenitate epigenetică, cu modificări de metilare care apar într-un mod stochastic în loc să urmeze modele uniforme.
Echipa de la Johns Hopkins s-a concentrat pe insulele CpG, deoarece aceste regiuni genomice au în mod tipic niveluri scăzute de metilare a ADN-ului.
Sursa: [Johns Hopkins Kimmel Cancer Center](linkul-catre-sursa-originala)
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
