Diagnosticarea unei infecții sanguine folosind metodele convenționale poate dura în mod obișnuit între două și șapte zile. După ce bacteriile sunt detectate într-o cultură de sânge, laboratoarele trebuie să izoleze coloniile, să identifice speciile și apoi să determine care antibiotice sunt susceptibile să fie eficiente. Aceste etape pot implica tehnologii specializate precum spectrometria de masă sau sistemele de testare a susceptibilității antimicrobiene.
Pentru a simplifica acest proces, cercetătorii au dezvoltat BADLOCK (Bacterial and AMR Detection by SHERLOCK) – o platformă de diagnostic cu cost redus bazată pe tehnologia CRISPR-Cas13a portabilă pentru detectarea secvențelor genetice specifice numite SHERLOCK. Reacția „one-pot” CRISPR-Cas13a a BADLOCK necesită doar un bloc de încălzire și un fluorimetru de bază, iar reactivii săi nu necesită depozitare la rece. Sistemul detectează țintele genetice specifice printr-o secvență de reacții moleculare care produc în final un semnal fluorescent atunci când ținta este prezentă.
În studiu, cercetătorii au testat BADLOCK pe 194 de culturi de sânge clinice colectate secvențial, precum și pe 69 de mostre fictive realizate din izoluri bacteriene bancare care transportau genele de rezistență vizate. Pe parcursul a 2.224 de reacții individuale, platforma a detectat nouă specii de bacterii Gram-negative și patru gene majore de rezistență antimicrobiană cu o acuratețe de 97,6%. Împreună, speciile bacteriene vizate de test reprezintă peste 3,3 milioane de decese anual la nivel global.
Într-o evaluare de concept folosind BADLOCK ca un diagnostic fără cultură pentru infecțiile tractului urinar, platforma a obținut o acuratețe de 98,0% la nivelul reacției, cu 95,3% dintre cele 43 de teste arătând fie un acord parțial, fie un acord perfect cu metodele standard de detectare pentru ambele specii bacteriene și gene de rezistență.
„Aceasta reprezintă prima demonstrație a platformei de diagnostic CRISPR-Cas13a pe infecțiile clinice de sânge până în prezent și susține potențialul BADLOCK-ului ca o soluție practică și scalabilă pentru detectarea rapidă a patogenilor și genelor de rezistență în medii cu resurse limitate”, scrie David Roach, MD, PhD, medic la Mass General Brigham, lector la Harvard Medical School și cercetător postdoctoral la Broad Institute of MIT și Harvard.
Identificarea rapidă atât a bacteriilor, cât și a genelor de rezistență ar putea reduce dependența excesivă actuală de antibiotice cu spectru larg atunci când rezultatele de laborator sunt întârziate sau indisponibile, ceea ce contribuie la rezistența antimicrobiană. Cu toate acestea, cercetătorii subliniază faptul că BADLOCK rămâne un prototip și teste suplimentare în spitale, regiuni geografice și populații de pacienți vor fi necesare pentru a stabili cât de fiabilă este platf
Sursa articol https://insideprecisionmedicine.com
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
