O nouă hartă unicelulară a adultului uman își propune să aducă această biologie într-o lumină mai clară. Într-un studiu publicat în revista Nature Cardiovascular Research, cercetătorii de la Broad Institute of MIT și Harvard și Mass General Brigham au dezvoltat HeartMap, o hartă integrată care cuprinde peste 2,4 milioane de nuclee cardiace din 209 indivizi.
Resursa adună date din nouă studii și include opt regiuni anatomice și șapte stări de sănătate sau de boală. Valoarea sa nu stă doar în amploare, ci și în încercarea de a face datele cardiace la nivel unicelular mai comparabile între diferite studii.
Medicina personalizată depinde de identificarea mecanismelor biologice care contează pentru un pacient sau un subtip de boală specific. În oncologie, acest lucru a însemnat din ce în ce mai mult potrivirea modificărilor moleculare cu terapiile țintite. Cardiologia a făcut progrese importante cu privire la genetică, imagistică, biomarkeri și stratificarea riscului, dar multe decizii terapeutice operează încă la un nivel relativ înalt al clasificării bolilor.
Boala cardiacă nu este condusă doar de cardiomiocite. Fibroblaștii, celulele endoteliale, celulele imune, celulele musculare netede vasculare, pericitii și alte populații contribuie toate la remodelare, inflamație, fibroză și disfuncție tisulară. Prin urmare, fenotipul clinic al unui pacient poate reflecta diferite combinații de programe celulare.
HeartMap a fost proiectat pentru a ajuta cercetătorii să investigheze acele programe. Autorii afirmă că diferențierea semnăturilor transcripționale între grupurile de boli cardiovasculare folosind HeartMap „ar putea ajuta în abordările de medicină de precizie” prin informarea descoperirii de biomarkeri și ținte terapeutice.
Secvențierea unicelulară și unicelulară a nucleelor au dezvăluit deja diferențe importante între țesutul cardiac sănătos și cel bolnav. Cu toate acestea, studiile individuale variază în ceea ce privește modul în care sunt colectate, procesate, secvențiate și analizate mostrele. Aceste diferențe pot ascunde dacă un semnal este cu adevărat legat de boală sau specific unei cohorte sau unui protocol.
Pentru a aborda aceste aspecte, echipa HeartMap a reprelucrat și armonizat seturile de date publicate, folosind integrarea computatională pentru a reduce variația tehnică, în timp ce păstrează semnalul biologic. Atlasul final a identificat 14 tipuri generale de celule cardiace și 52 de grupuri.
Pe tot atlasul, inimile bolnave și cele non-defecte s-au separat prin modele de expresie genetică. Comparările boală-versus-control au produs mai multe gene diferențial exprimate decât comparațiile între stările de boală, sugerând că diferitele condiții cardiovasculare împărtășesc programe largi de remodelare, în timp ce păstrează caracteristici moleculare mai specifice.
Această distincție este importantă pentru traducere. Programele comune de leziuni pot ajuta la explicarea mai
Sursa articol https://insideprecisionmedicine.com
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
