Cercetătorii au analizat 55 de modificări diferite ale ARN-ului în sângele periferic al pacienților cu HCC, al indivizilor cu ciroză hepatică și al subiecților sănătoși. Analiza lor a identificat o combinație de modificări ale ARN-ului și markeri de exprimare genică capabili să distingă HCC, cu valori ale curbei caracteristice de operare a receptorului (AUC) apropiindu-se de 0,97.
Moleculele ARN pot suferi numeroase modificări chimice după ce sunt produse, modificări care le pot altera stabilitatea, structura, traducerea și alte funcții biologice. S-au identificat peste 170 de modificări ale ARN-ului, însă puține cercetări s-au ocupat de analizarea dacă modelele lor în sângele periferic ar putea servi drept biomarkeri diagnostici pentru cancerul de ficat.
Folosind spectrometria de masă tandem cu cromatografia lichidă, cercetătorii au cuantificat cele 55 de modificări. Unsprezece dintre acestea au fost semnificativ alterate atât în grupul general de HCC, cât și la pacienții cu stadiul I de boală, comparativ cu grupul combinat non-HCC format din participanți sănătoși și pacienți cu ciroză.
O anumită modificare, N²,N²-dimetilguanozină, sau m²,²G, s-a evidențiat ca componentă principală a semnăturii asociate cu HCC.
Un model bazat pe modificările ARN-ului a reușit să distingă mostrele de HCC de cele non-HCC, inclusiv la pacienții cu stadiul I de boală. Cercetătorii au adăugat apoi doi markeri de exprimare genică din sânge, IFI27 și CCR2, pentru a vedea dacă combinarea diferitelor tipuri de informații moleculare ar putea îmbunătăți detectarea.
Modelul combinat multi-omic a avut o performanță chiar mai bună, atingând o AUC de aproximativ 0,97 atât pentru HCC în general, cât și pentru stadiul I al bolii. Semnătura finală a adus împreună trei modificări ARN cu expresia IFI27 și CCR2.
Această lucrare reprezintă o abordare emergentă a diagnosticului de precizie, uneori denumită epitranscriptomică, adică studiul modificărilor chimice făcute ARN-ului. Deși majoritatea dezvoltării biopsiilor lichide s-au concentrat pe mutațiile ADN-ului tumoral circulant, metilarea ADN-ului, celulele tumorale circulante sau exprimarea ARN-ului, profilarea modificărilor ARN-ului ar putea oferi o altă sursă de informații biologice.
Rezultatele sunt deosebit de importante pentru stadiul I al HCC, unde detectarea precoce poate extinde substanțial opțiunile de tratament. Cu toate acestea, autorii caracterizează descoperirile drept preliminare.
Pentru a putea fi considerată pentru screening sau supraveghere clinică, performanța semnăturii va trebui validată în populații independente și mai mari. În cazul validării, combinarea modelelor de modificare ARN cu markerii de exprimare genică ar putea oferi o nouă strategie multi-omică pentru distingerea cancerului hepatic de ciroză și alte afecțiuni hepatice cronice.
Sursa articol https://insideprecisionmedicine.com
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
