Această unealtă, creată de oamenii de știință de la Institutul de Știința Datelor și Inteligența artificială învață din arborele vieții pentru a susține diagnosticarea bolilor rare" class="aigl-auto-link">Inteligență Artificială (DATAI), membri ai Centrului de Cancer Clínica Universidad de Navarra, a fost validată cu date din 13 tipuri de tumori din consorțiul internațional The Cancer Genome Atlas (TCGA).
Publicat în revista PLOS Computational Biology, RNACOREX analizează simultan mii de molecule pentru a detecta interacțiunile cheie care rămân adesea nedetectate folosind abordările analitice convenționale.
Această unealtă oferă cercetătorilor o „hartă” moleculară interpretabilă care îmbunătățește înțelegerea tumorilor și deschide noi căi pentru dezvăluirea mecanismelor care conduc progresia tumorii.
În interiorul celulelor noastre, diferite tipuri de molecule – cum ar fi microARN-urile (miARN-uri) și ARN-ul mesager (ARNm) – comunică prin rețele reglementare extrem de complexe. Atunci când aceste conexiuni se destramă, pot apărea cancere și alte boli.
„Înțelegerea arhitecturii acestor rețele este crucială pentru detectarea, studierea și clasificarea diferitelor tipuri de tumori. Cu toate acestea, identificarea cu încredere a acestor rețele reprezintă o provocare datorită cantității enorme de date disponibile, prezența multor semnale false și lipsa uneltelor accesibile și precise capabile să distingă ce interacțiuni moleculare sunt cu adevărat asociate cu fiecare boală,” declară Rubén Armañanzas, șeful Laboratorului de Medicină Digitală de la DATAI și unul dintre autorii principali ai studiului.
RNACOREX abordează această problemă combinând informații din baze de date internaționale cu analiza reală a datelor de expresie a genelor pentru a clasifica interacțiunile miARN–ARNm cele mai biologic relevante. Folosind aceste informații, deduce rețele reglementare tot mai complexe care ar putea servi și ca modele probabilistice puternice.
Pentru a evalua performanța sa, cercetătorii au evaluat RNACOREX pe 13 tipuri de cancer – de la sân și colon până la plămân, stomac, melanom și cap și gât – folosind date din consorțiul The Cancer Genome Atlas (TCGA).
„Software-ul a prezis supraviețuirea pacienților cu o precizie comparabilă cu modelele AI sofisticate, dar cu ceva ce multe dintre acele sisteme lipsesc: explicații clare și interpretabile ale interacțiunilor moleculare din spatele rezultatelor,” adaugă Aitor Oviedo-Madrid, un cercetător la Laboratorul de Medicină Digitală de la DATAI și primul autor al studiului.
RNACOREX nu identifică doar rețele reglementare asociate cu rezultate clinice, dar descoperă și modele moleculare împărtășite între tipurile de tumori și evidențiază molecule individuale de particu
Sursa: [Link catre sursa originala a informatiei]
Editor RevistaSanatatii.ro. Isi doreste ca activitatea lui sa aduca speranta milioanelor de oameni bolnavi din Romania, sa le aline suferintele si sa le ofere speranta.
