Revolutia genomics a suferit o transformare atat de rapida, incat chiar si oamenii de stiinta experimentati remarcă viteza sa. Costurile secventierii care păreau imposibil de reduse acum un deceniu au scăzut și mai mult. Tehnologiile spatiale și celulare unice nu mai populează doar institutele de top, ci și spitalele de cercetare de dimensiuni medii. Medicii se așteaptă tot mai mult la informații moleculare în momentul diagnosticării, nu luni mai târziu. Imaginația științifică s-a extins corespunzător: secvențierea întregului genom pentru screening-ul nou-născuților, atlasele celulare unice pentru organe întregi și profilarea tumorilor în timp real în timpul terapiei sunt acum normale.
Cu toate acestea, în mijlocul acestei accelerări, a apărut un blocaj curios. Secventierea, cândva pasul limitant, este adesea cea mai simplă parte. Părțile dificile se află în amonte și în avalul secvențierii: pregătirea bibliotecilor impecabile și extragerea unei semnificații coerente din fluxurile masive de date. Știința genomică de astăzi depinde de mai mult decât de viteza instrumentelor. Ea depinde de coregrafie – incubații precis cronometrate, etape de legare și eluție a margelelor, micro-pipetare a volumelor de microlitri și sute de acțiuni discrete efectuate fără eroare. În aval, interpretarea bioinformatică creează propriile cerințe pentru standardizare, transparență și reproducibilitate.
Ritmul schimbării nu face decât să complice complexitatea. „Kituri, secventiere și metode noi apar constant,” a spus Michelle Hiscutt, doctor în științe, manager specializat în piața diviziei europene de științe ale vieții și de diagnostic la Agilent. „Exact când un laborator validează un flux de lucru, următorul avans este deja stârnind valuri.” Automatizarea a servit odată ca o forță stabilizatoare; astăzi trebuie să fie atât stabilizatoare, cât și adaptabilă. În loc să congeleze un protocol în loc, automatizarea modernă trebuie să absoarbă noutatea.
Prin interviuri cu liderii de la Agilent, Integrated DNA Technologies (IDT), Opentrons Labworks, Illumina, MGI Tech, 10x Genomics și SPT Labtech, a apărut o narațiune constantă. Automatizarea nu mai este simplă mecanizare. Devine definibilă prin software, modulară, conștientă de senzori și din ce în ce mai împletită cu inteligența artificială (AI). În același timp, trebuie să rămână de încredere, accesibilă și plasabilă dincolo de câteva centre de cercetare bogate în capital. Domeniul se îndreaptă către un nou ideal: automatizarea nu doar ca eficiență, ci ca infrastructură pentru medicina de precizie echitabilă.
Agilent s-a orientat către acest nou paradigma. Stația sa de lucru Bravo NGS a fost mult timp considerată una dintre manipulatoarele lichide automate mai flexibile pentru fluxurile de lucru genomice. Acea flexibilitate acum pare a fi o decizie de proiectare prevăzătoare. „Noi încurajăm laboratoarele să inoveze fără a fi constrânse de sisteme rigide,” a spus Hiscutt. În practică, aceasta înseamnă fluxuri de lucru care pot adapta noi chimii fără mecani
Sursa: [Link către sursa originală, dacă este disponibil]
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.