„Credem că oncRNA-urile reprezintă o nouă clasă de molecule emergente în cancer care funcționează atât ca factori de conducere, cât și ca biomarkeri,” scriu autorii studiului, coordonați de Hani Goodarzi, PhD, profesor asociat la Universitatea din California, San Francisco și investigator principal la Institutul Arc. „Sperăm ca această resursă, pe care am făcut-o open-source, să deschidă noi direcții în domeniu.”
Goodarzi și colegii săi au raportat inițial descoperirea oncRNA-urilor încă din 2018, definindu-le ca fiind ARN-uri mici non-codificatoare exprimate de celulele canceroase, dar absente din țesuturile sănătoase. În timp ce lucrarile anterioare au explorat rolul pe care una dintre aceste molecule îl joacă în promovarea metastazei cancerului la sân, noul studiu a analizat datele de secvențiere ARN din 32 de tipuri de cancer, obținute din Atlasul Genomului Cancerului.
Au fost identificate peste 260.000 de oncRNA-uri, iar rezultatele au arătat că fiecare tip de cancer produce modele distincte de expresie a oncRNA-urilor. Aceste diferențe au fost valorificate pentru a dezvolta un algoritm de învățare automată care putea clasifica tipurile de cancer cu o exactitate de peste 90%. Într-o cohortă independentă ce include mostre de la peste 900 de tumori, algoritmul a atins o exactitate de 82%.
Analiza a relevat, de asemenea, variații între subtipurile de cancer. De exemplu, tumori bazale la sân au prezentat modele diferite de oncRNA-uri față de cancerele luminal. „Acest lucru sugerează că aceste molecule ne transmit ceva fundamental despre starea celulelor canceroase,” afirmă Goodarzi și colegii. „Cu alte cuvinte, modelele de prezență și absență a oncRNA-urilor servesc ca ‘coduri de bare moleculare digitale’ care capturează identitatea celulelor canceroase, de la tipul de cancer la subtip și chiar stadiile celulare.”
Ulterior, cercetătorii au investigat dacă oncRNA-urile joacă un rol activ în progresia cancerului. Folosind screening-uri genetice la scară largă în șoareci xenograft, ei au descoperit că aproximativ 5% dintre cele 400 de oncRNA-uri testate puteau stimula creșterea tumorilor. Două dintre acestea au fost selectate pentru a fi studiate mai detaliat; unul a fost identificat ca promovând tranziția epitelial-mesenchimală, un proces critic în timpul metastazei, în timp ce celălalt a activat căile genetice E2F care stimulează proliferarea celulelor canceroase. Ambele au fost asociate cu o creștere a tumorilor și a metastazelor în linii celulare umane și date de tumori de la pacienți.
„Cel mai interesant clinic este faptul că celulele canceroase eliberează aceste ARN-uri în sânge, iar urmărirea lor poate oferi informații despre starea pacienților,” scriu cercetătorii. „Știam că aceste ARN-uri apar în sânge, dar nu se știa dacă ar fi informative în mostrele reale de la pacienți. Faptul că am avut nevoie de doar un mililitru de ser și s
Sursa: [Link către sursa originală a informației]
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.
