Noul instrument independent de cale, dezvoltat de Wenyi Wang, PhD, profesor de bioinformatică și biologie computațională, și colegii săi, este derivat din datele secvențierii ARN și ADN corelate.
„Majoritatea strategiilor existente de clasificare TNBC, cum ar fi subtipurile Lehmann sau Fudan University Shanghai Cancer Center (FUSCC), se bazează pe modele de expresie ale genelor selectate singure, întrebând practic ‘ce tipuri de gene sunt activate'”, a explicat Wang.
„Abordarea noastră cu TmS abordează o perspectivă diferită, întrebând ‘care este nivelul total de expresie sumat peste toate genele’. Pentru TNBC în mod specific, TmS oferă un avantaj unic pentru a măsura dinamica între activitățile transcripționale pentru celulele tumorale și cele pentru celulele stromale și imune din microambianta tumorală”, a declarat ea pentru Inside Precision Medicine.
Wang și echipa sa au raportat în Cell Reports Medicine că, într-o analiză a 575 de pacienți cu TNBC din patru colecții etnice diverse, TmS a separat pacienții în cei cu tumori cu TmS ridicat, asociate cu o prognostic mai bun, și cei cu tumori cu TmS scăzut, asociate cu rezultate mai slabe.
În plus, metoda a depășit subtipurile de clasificare Lehmann TNBCtype-4 și FUSCC în prezicerea rezultatelor chimioterapiei, iar beneficiul de supraviețuire asociat cu TmS ridicat a fost consistent în toate cele patru colecții.
În schimb, subgrupurile TNBCtype-4 ale acelorași pacienți nu au arătat diferențe semnificative în rezultatele de supraviețuire.
„Cele patru colecții din studiul nostru acoperă diferite etnii, protocoale de tratament clinic și platforme de secvențiere, așa că obținerea unor constatări prognostice consistente în toate acestea nu era garantată, să spunem cel puțin”, a spus coautorul studiului, Bora Lim, MD, profesor asociat la departamentul de oncologie medicală a sânului la MD Anderson.
Cercetătorii au presupus că distincțiile între TmS și sistemele anterioare de clasificare TNBC ar putea indica faptul că subtipurile contrastante de TmS ar putea fi asociate cu diferite activități biologice la nivel celular.
„Ceea ce am descoperit a fost că TmS scăzut a identificat în mod constant un mediu microbian imunosupresor, îmbogățit cu matrice extracelulară (ECM) asociat cu rezultate mai proaste în fiecare colecție, în timp ce semnătura de activare a imunității caracteristică TmS ridicat a fost mai pronunțată în colecțiile occidentale”, a spus Lim.
„Aceasta sugerează că anumite caracteristici biologice captate de TmS sunt cu adevărat universale în rândul populațiilor etnice, în timp ce altele pot reflecta diferențe la nivel de populație în interacțiunile tumorale-imune care necesită investigații suplimentare. Această combinație de reproductibilitate și subtilitate biologică a fost, cred eu, unul dintre aspectele cele mai convingătoare ale studiului.”
Sursa: [Link către sursa originală a informației]
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.