„În ciuda diversității proceselor mutaționale, consecințele lor la nivel de proteină converg către doar cinci amprente recurente, care pot influența puternic recunoașterea imună”, a declarat autorul principal al studiului, Szilvia Juhász, doctor în științe, șeful Grupului de Cercetare a Microbiomului Cancerului la HCEMM.
Genomurile canceroase poartă amprenta expunerilor la mediu, cum ar fi fumul de tutun și radiațiile ultraviolete, precum și procesele interne precum erorile de reparare a ADN-ului. Aceste procese lasă semne caracteristice în ADN, numite semnături mutaționale. În timp ce astfel de semne au fost folosite pe scară largă pentru a urmări originile și expunerile cancerului, nu a fost clar cum aceste caracteristici ar putea afecta modul în care tumorile unui individ răspund la tratament. Echipa condusă de HCEMM a căutat să umple această lacună concentrându-se nu pe schimbările de nucleotide, ci pe modul în care mutațiile alterează aminoacizii din proteine – semnăturile de substituție a aminoacizilor (AAS).
„Am formulat ipoteza că anumite surse de mutații generează preferențial substituții ale aminoacizilor care evită recunoașterea imună, producând tumori reci din punct de vedere imun, indiferent de țesut sau încărcătură mutațională”, au scris cercetătorii.
Pentru a investiga această posibilitate, echipa a analizat datele existente de secvențiere a exomului din peste 9.000 de tumori din diverse tipuri de cancer și apoi a adăugat la acestea datele lor din experimente de mutageneză. Abordarea aceasta le-a permis cercetătorilor să stabilească legături între mutagenii de mediu, defectele în căile de reparare a ADN-ului și modele recurente de substituții de aminoacizi. Această analiză a arătat că, în loc de o gamă largă de rezultate, tumorile se grupau în mod tipic în cinci categorii dominante de AAS (AAS1 până la AAS5), fiecare cu propria sa funcție distinctă, reflectând diferite procese mutaționale subiacente.
Conform cercetării, AAS1 este asociat cu mutagenii din fumul de tutun și daune oxidative, AAS2 cu lumina ultravioletă și repararea bazelor, AAS3 și AAS4 cu diferite tipuri de defecte ale reparării neconcordante, iar AAS5 cu mutageneza indusă de APOBEC.
În special, semnătura AAS4 a fost puternic asociată cu evitarea imună. Cauzată de agenți alchilanti și de deficiența în repararea neconcordantă, AAS4 a fost îmbogățită în cancerele de rinichi și ficat și a prezentat o tendință redusă de a acumula aminoacizi hidrofobi. Această tendință biochimică a condus la producerea de neopeptide mai puțin susceptibile să fie recunoscute.
Sursa: [Link către sursa originală a informației, dacă este disponibil]
Senior Editor RevistaSanatatii.ro. Pasionat de lifespan, fan David Sinclair.